盘点两种使用Python读取.nc文件的方法,
盘点两种使用Python读取.nc文件的方法,
大家好,我是Python进阶者。
前言
前几天有个叫的粉丝在Python钻石交流群里问了一道关于.nc文件读取的问题,如下图所示。
.nc文件和常规的文件不太一样,有专门的第三方处理库,netCDF4,需要安装才行。
- pip install netCDF4
如果觉得下载的慢,可以使用换源的方法进行下载:
- pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple netCDF4
关于永久换源可以参考这个文章:手把手教你进行pip换源,让你的Python库下载嗖嗖的(系列二)、手把手教你进行pip换源,让你的Python库下载嗖嗖的。
一、nc文件基础知识
nc 全称 netCDF(The Network Common Data Form),可以用来存储一系列的数组,就是这么简单。关于nc文件的介绍,可以参考:
https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/docs/netcdf_introduction.html
既然 nc 可以用来一系列的数组,所以经常被用来存储科学观测数据,最好还是长时间序列的。
试想一下一个科学家每隔一分钟采集一次实验数据并存储了下来,如果不用这种格式存储,时间长了可能就需要创建一系列的 csv 或者 txt 等,而采用 nc 一个文件就可以搞定,是不是很方便呢?
更方便的是如果这个科学实验与气象、水文、温度等地理信息稍微沾点边的,完全也可以用 nc 进行存储, GeoTiff 顶多能多存几个波段(此处波段可以认为是气象、水文等不同信号),而 nc 可以存储不同波段的长时间观测结果,是不是非常方便呢?
二、解决方案
方法一:常规读取 这个方法是在网上找到的,代码如下,其中关键部分有注释,应该都可以看得懂。
- # -*- coding: utf-8 -*-
- import netCDF4
- from netCDF4 import Dataset
- nc_obj = Dataset('D:\\tem_e0025_2.nc')
- # 查看nc文件有些啥东东
- # print(nc_obj)
- # print('---------------------------------------')
- # 查看nc文件中的变量,结果是:['lon', 'lat', 'lev', 'time', 'tem']
- # print(nc_obj.variables.keys())
- # for i in nc_obj.variables.keys():
- # print(i)
- # print('---------------------------------------')
- # 查看每个变量的信息
- # print(nc_obj.variables['lat'])
- # print(nc_obj.variables['lon'])
- # print(nc_obj.variables['lev'])
- # print(nc_obj.variables['time'])
- # print(nc_obj.variables['tem'])
- # print('---------------------------------------')
- # 查看每个变量的属性
- # print(nc_obj.variables['lat'].ncattrs())
- # print(nc_obj.variables['lon'].ncattrs())
- # print(nc_obj.variables['lev'].ncattrs())
- # print(nc_obj.variables['time'].ncattrs())
- # print(nc_obj.variables['tem'].ncattrs())
- #
- # print(nc_obj.variables['lat'].units)
- # print(nc_obj.variables['lon'].units)
- # print('---------------------------------------')
- # 读取数据值
- lat = (nc_obj.variables['lat'][:])
- lon = (nc_obj.variables['lon'][:])
- lev = (nc_obj.variables['lev'][:])
- # print(lev)
- time = (nc_obj.variables['time'][:])
- tem = (nc_obj.variables['tem'][:])
- # lat = (nc_obj.variables['lat'][1:2])
- # lon = (nc_obj.variables['lon'][1:2])
- # lev = (nc_obj.variables['lev'][1:2])
- # time1 = (nc_obj.variables['time'][1:2])
- # tem = (nc_obj.variables['tem'][1:2])
- # print(lat)
- # print(len(lat))
- # print(lon)
- # print(lev)
- # print(time1)
- # print(len(time))
- # print(tem)
- # print('---------------******-------------------')
- file = open('ppm_lat.txt', 'a')
- file.write('lat,lon,time,tem'+'\n')
- file.write('lat,lon'+'\n')
- file.write('lat'+'\n')
- for i in range(len(lat)):
- file.write(str(lat[i])+',\n')
- file.write(str(lon[i])+',')
- file.write(str(lev[i])+',')
- file.write(str(time[i])+',')
- file.write(str(tem[i])+',\n')
- file.close()
你只需要替换代码中的nc文件路径即可,其他的内容,你可以自行自取。
方法二:直接取值 这个方法是自己提供的,也是可以读取文件,进行取值的。
- # -*- coding: utf-8 -*-
- import netCDF4
- from netCDF4 import Dataset
- # 查看nc文件中的变量,结果是:['lon', 'lat', 'lev', 'time', 'tem']
- # print(nc_obj.variables.keys())
- # for i in nc_obj.variables.keys():
- # print(i)
- # print('---------------------------------------')
- A_temp = Dataset(r'E:\PythonCrawler\有趣的代码\数据分析\最小二乘法数据分析代码和数据\Temperature_20211031.nc')
- lat = A_temp['latitude'][:].data # 497个数字
- lon = A_temp['longitude'][:].data # 409个数字
- temp = A_temp['T'][:].data # 409个数字
- depth = A_temp['depth'][:].data # 51个数字
- print(len(lat))
- print(len(lon))
本文参考链接:1. https://blog.csdn.net/showpingzhang/article/details/833847802. https://www.cnblogs.com/shoufengwei/p/9068379.html
取值之后,接下来做回归、聚类等,就不展开赘述了。
三、总结
我是Python进阶者。本文基于粉丝提问,针对.nc文件读取的问题,给出了两种解决方法,顺利帮助粉丝解决了问题。
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